- 软件介绍
软件功能
In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion®克隆技术是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。SnapGene是第一个模拟此程序的软件。只需选择您想要融合的DNA片段，SnapGene即可设计引物。
GibsonAssembly
许多研究人员转向吉布森大会，不使用限制性内切酶将片段插入质粒。通过PCR扩增待连接的DNA片段以产生重叠末端。SnapGene简化了吉布森装配反应的计划，并自动化了底漆设计。
限制性克隆
SnapGene独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。规划克隆程序从未如此简单。如果你已经知道你想要做什么，克隆模拟只需要几秒钟。如果克隆程序存在设计缺陷，则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
PCR&诱变 设计引物后，可用它们来模拟常规PCR，重叠延伸PCR或诱变。产生的DNA序列文件立即可用于进一步操作。与限制性克隆界面一样，针对引物的界面以直观的方式显示关键信息。
自动文档 SnapGene最令人惊奇的地方在于它会自动记录克隆项目中的步骤。每次编辑序列或模拟克隆或PCR或诱变时，该程序都会自动记录在图形历史记录中。在模拟DNA构建体的创建之后，您可以将历史记录用作实验方案。嵌入在最终文件中的是所有的祖先构造，其中的每一个都可以作为单独的文件复活。
琼脂糖凝胶电泳
SnapGene使用先进的算法来创建逼真的琼脂糖凝胶模拟。限制片段以三种格式显示：模拟凝胶，数字列表和序列图。您可以使用模拟凝胶计划诊断性限制消化，或将实际凝胶图像与预测模式进行比较。
使用SnapGene，DNA序列中的注释功能非常简单。SnapGene格式与GenBank标准相匹配，但添加了诸如颜色，方向性和片段等选项。编码序列被翻译，以便您可以可视化密码子，追踪氨基酸编号，并检查阅读框架以寻找基因融合。功能可以从其他文件导入，或者从可定制列表中自动注释。
SnapGene为引物的设计和可视化提供了革命性的工具。与许多其他程序不同，SnapGene使用严格的热力学算法来计算解链温度和双链路线。您可以使用引物模拟程序，如PCR，诱变和In-Fusion克隆。引物可以从其他文件导入或导出为文本格式。
大序列
在这个基因组时代，你的分子生物学软件应该能够处理染色体大小的序列。由于采用了专有的MICA算法，SnapGene可以用于浏览具有数千个注释功能的大型序列。智能搜索和缩放控制使得染色体的导航非常简单。
多功能数据导入和导出
SnapGene可以读取许多常见的文件格式，捕获DNA序列和注释。支持的格式列表包括 APE， DNASTAR的Lasergene， 基因工程Kit， 基因库， MacVector， 矢量NTI，等等。
可以将质粒图导出为图像文件，并且可以以图像或文本格式导出琼脂糖凝胶模拟。您可以将序列导出为其他程序可以读取的GenBank文件...或者，由于SnapGene Viewer的原因，您可以与世界上的任何人共享文件。
软件特色
SnapGene for mac还能将它们导出到其他 fomats。由于这个软件，分子生物学家有可能使，探索或共享共享详细的 DNA 序列文件。
免费SnapGene查看器实用程序与同事共享结果。
查看、记录和注释DNA序列
在SnapGene用户界面中，您可以可视化DNA序列结构。应用程序在生成表示时遵循GenBank标准。
此外，SnapGene集成了各种定制选项，允许您查看特定的片段，更改方向或颜色标记。
应用程序可以单独突出显示潜在的打开读取帧，但也允许您调整参数以获得更精确的结果。
使用特定的方法处理数据
SnapGene整合了对融合克隆、Gibson组装程序、限制性克隆、PCR和诱变的支持。执行特定过程时的所有步骤都会被自动记录下来，这样您就可以清楚地记录所有步骤。
此外，SnapGene还可用于生成琼脂糖凝胶模拟，或突出被甲基化篡改的位点。后一种功能非常有用，如果您需要识别可行的酶集。
最后但并非最不重要的是，SnapGene包含了可以用来确定双工排列和熔化温度的热力学算法。这样，您就可以设计用于模拟各种过程的引物。
全面的分子生物学应用，运动广泛的文献工具
除了所有可以帮助您模拟各种过程和分析结果的工具之外，SnapGene还打包了详尽的文档功能，可以记录您的所有步骤。
所有信息都可以导出到GenBank文件格式、与类似应用程序兼容的其他格式，甚至可以导出到易于共享的图像文件。
软件更新内容
版本 4.1.8更新内容：
增强功能：
将最大允许引物长度增加至250个碱基。
大大加快了大型FASTQ文件的开放速度。
增强了“Make Protein”转换器，将DNA颜色转移到蛋白质序列。
允许的protein_bind功能是双向的。
提供选项，在集合中使用“文件夹”视图时，通过点击macOS上的Enter / Return或Windows上的F2来重命名所选文件或文件夹。
通过首先指定正确的端点，启用从NCBI导入一系列碱基的反向互补。
增强了多重对齐工具以接受序列跟踪作为输入。
确保在切换到集合中的另一个序列文件然后返回时，查找栏和搜索结果仍然可见。
更新了常用功能数据库。
MAFFT从7.312更新到7.407。
制作各种颜色，文字和其他视觉增强功能。
修复：
改进了Windows上的网络通信。
修复了在GenBank或GenPept序列中粘贴后更改新DNA或蛋白质文件名称导致所有功能丢失的问题。
修复了为欧洲用户使用正确的组和小数分隔符的许多问题。
改进了从Excel等程序复制到剪贴板的引物的导入。
修复了导致“说明”面板中的内容不可见或显示错误字体的问题。
改进了自定义常用功能的编辑。
在区分大小写的APFS文件系统上运行SnapGene时，提高了稳定性。
改进了Geneious文件中功能的解码。
防止在检测常见功能时可能发生的重复注释。
通过序列名称搜索集合时防止误报。
启用了粘贴到以“”开头的各种文本控件。
更正了在打印时导致字体大小过大的回归。
通过从SnapGene复制并粘贴到Excel等程序中来修正回归。
确保默认显示打开/保存/导出的默认目录。
改进了RTF编码文件的打开。
